Bugün dünyadaki herkes akıllı telefon uygulamalarını kullanıyor. Bu uygulamalarda, Appli Monsters adı verilen ve Appmon olarak da bilinen yaratıklar, bilmedikleri bir yerde yaşamaktadır. Appmon, gerçek ve dijital dünyalar arasındaki boşlukta işlev gören ve insan ile sistem arasında aracılık yapan, kendileri için düşünme ve hareket etme yeteneğine sahip yapay zekaya sahip yaşam formlarıdır. Bununla birlikte, İnternet okyanusunda gizlenen, Appmon'u kontrol etmek için bir virüs kullanan ve insan dünyasını İnternet'ten kontrol etmek için sisteme giren iğrenç bir yapay zekalı "son patron" Leviathan'dır.Yedinci sınıf öğrencisi Haru Shinkai , bir Appli Drive satın aldı ve bir Appmon Chip kullanarak bir arama uygulaması olan Gatchmon'u hayata geçirdi. Appli Drive'ın arkasındaki gizem, Appmon'un bulunduğu gerçek ve dijital dünyalar arasındaki gizemli alanın varlığı ve iki Appmon'un tek bir dünyaya dönüşmesine izin veren "App Gattai" nedir? Leviathan'ın amacı tam olarak nedir? Günümüzde internette dolaşan Haru ve Gatchmon'un tuhaf ikilisinin arkadaşlık hikayesi şimdi başlıyor!