Yui, tüm bilgisayarların COMNET olarak bilinen tek bir küresel ağ tarafından desteklendiği bir gelecekte yaşayan ortalama bir kız öğrencidir. Yui bilgisayar okuma yazması olmayan bir kızdır ve bir bilgisayar laboratuvarı kazasından sonra rakun görünümlü bir düzeltici bilgisayar programı olan IR ona COMNET'i kurtarması gerektiğini söyler. O haydut A.I.'yi durdurmalı. (Yapay Zeka) Grosser olarak bilinen bilgisayar programı ve onun yardımcı programları dünyayı ele geçiriyor. Grosser başlangıçta tüm COMNET'in yöneticisi olmak için tasarlandı. İlk başta, bilgisayarlarla ilgili bilgi ve beceri eksikliğinden dolayı kadın kahramanı oynamak konusunda çok isteksizdir. COMNET'i kurtarmak için diğer yedi asi düzeltici programı bulmalı ve güvenini kazanmalıdır. Ayrıca Grosser'ı sonsuza kadar durdurmaya yardımcı olmak için yaratıcıyı veya COMNET Profesörü Inukai'yi bulmaları gerekir.