Kaito Kuroba, sihirbaz olmayı ve sınıf arkadaşlarına gösteriş yapmayı seven normal bir genç öğrencidir. Babası 8 yıl önce bir kazada ölür ve daha sonra babasının çifte yaşamından kaynaklandığını öğrenir. Kaito, babasının Kaitou Kid the Phantom Thief olarak bilinen ünlü bir uluslararası suçlu olduğunu ve "Pandora Gem" i almalarına yardım etmeyi reddettiği için gizemli bir organizasyon tarafından öldürüldüğünü öğrenir. Örgütün mücevheri kazanmasını engellemeye yemin eder ve babasının gizli kimliğini kaitou çocuğu olarak üstlenir.