Efsanevi NCIS ajanı Sam Hanna, memleketi New York'a, saha ofisine geri dönüyor. Kurnaz bir ajanla ortaklık kurarak yeni bir ekibe liderlik ediyor ve dünyanın en önemli şehirlerinden ve limanlarından birini savunmak için yüksek riskli görevler üstleniyorlar.