Tomoro Tenma, "e-Nabız" olarak bilinen insan düşünce ve duygularının, Sapotama adlı yapay zekâ cihazlarına güç verdiği bir dünyada yaşıyor. Ancak Digimon'lar Sapotama'dan maddeleşip e-Nabız'la beslenmeye başlayınca toplum parçalanmaya başlıyor. Gekkomon'un cihazından çıkmasının ardından Tomoro, haydut Digimon'ları ve hem duygularla beslenen hem de yozlaşan bir sistemin karanlık gerçeklerini araştıran gizli bir ekip olan Glowing Dawn'a katılıyor.