Şans ve etrafındaki karışıklıkların birleşimi sayesinde bilmeden zor vakaları çözen kibirli Yabe Kenzo, astı bilgisayar kurdu Akiba Harando ile geri döner. İtaatkâr Akiba, Yabe'nin muamelesinden geri adım atmasa da, bu sefer ilişkilerinde alışılmadık bir şey ortaya çıkar. Yabe, kendini bugüne kadarki en güçlü rakibiyle karşı karşıya bulur. Suç soruşturmaları için özelleştirilmiş yapay zeka "Tanrı Gözü Joe"yu icat eden dahi bilim insanı Deep Manabu, FBI ve Scotland Yard'ın bile vazgeçtiği ardışık vakaları çözmektedir. Japon polisinin çaresiz kaldığı "karanlığın hakemi" olarak adlandırılan bir katili yakalamak için bunu kullanacağını açıklar. Manevra alanı kalmayan polis komiseri, sorumluluğu başkasına devretmek için Yabe'yi tam zamanlı soruşturmacı olarak görevlendirir. Bundan habersiz Yabe, "karanlığın hakemi"ni görgü tanıklarının gördüğü bir kaplıca bölgesine neşeyle gider. Heyelan olur ve bir han, ücra bir ada gibi kesilir. Ardından, handa misafir olan bir şirket başkanı öldürülür. Yabe'nin gözetiminde, hanın sahibi Yamakawa Tamao ve misafirleri, çevrede ipucu aramak için gruplara ayrılır. Katilin kişisel eşyaları orman yolunda bulunur ve Yabe, Akiba ile birlikte peşine düşer. Bu sırada Deep Manabu, davayı analiz etmekle meşguldür. Peruklu adam ile bu kana susamış katilin soruşturmasında yapay zekâ kullanan adam arasında çetin bir fikir mücadelesi başlamak üzeredir.