Pokemon Origins, var olan tüm Pokémon'u yakalayıp kataloglayarak "Pokédex" ini tamamlama girişiminde Kanto bölgesinde yaptığı yolculukta Red'i takip ediyor. Yol boyunca kendisi ve hedefleri hakkında düşündüğünden daha fazlası olduğunu keşfedecektir. Red, Elite Four'a meydan okumak ve Pokémon League Şampiyonu olmak için liderleri Pokémon League'e giden özel Spor Salonlarında hem kendisini hem de Pokémon'unu test etmek zorunda kalacak. , Red'in başka sorunları var. Kötü şöhretli suç örgütü Team Rocket bunlardan biri olduğu için Pokémon'u daha uğursuz nedenlerle yakalayan ve eğiten başkaları da var. Red onları, diğer antrenörleri, rakibi Green'i ve vahşi Pokémon'u Kanto boyunca yenebilirse, kendi hayalini ve Doktor Ookido'yu da gerçekleştirebilir.