Aibolit adında nazik bir doktor, yaralarına bakmaksızın hayvanları ilgisizce tedavi eder - çiziklerden, kesiklerden ve basit ısırıklardan karmaşık cerrahi operasyonlara kadar. Adı uzun zamandır çocukları korkutan kötü soyguncu Barmalay, Su Aygırı'nın koruması altında hapishanede oturmaktadır. Korsan arkadaşlar liderlerinin kaçmasına yardım eder, ancak Su Aygırı gemilerine gizlice girer ve kötü adamların planlarını bulmaya çalışır. Bu sırada, iyi Dr. Aibolit'in kavgacı kız kardeşi Varvara, doktorun sevdiği ve tedavi ettiği hayvanlardan nefret ettiğini söyleyerek kardeşini terk eder. Kısa süre sonra, şans eseri, kendini Afrika kıyılarına yanaşan bir korsan teknesinde bulur. Orada, soyguncular hayvanlar için trajikomik bir opera olan "Mukha-Tsokotukha" düzenler ve ardından zehirli yiyecekler dağıtırlar ve tüm hayvanlar hastalanır.