Shunta Mogami, Battle Spirits oyununa bayılıyor. Bir gün, bir Battle Spirits kartından yayılan bir ışıkla tüm Battle Spirits'lerin kökeni olan Ruhlar Dünyası'na ışınlanıyor. Orada, bir zamanlar Ruhlar Dünyası'nın yıkımını planlayan, ancak yenilgiye uğratılıp mühürlenen, yeniden dirilen Kötü Tanrı Kral'ın elinden bu dünyanın yok olmasını engellemek için onu Ruhlar Dünyası'na çağırdığını iddia eden Eto adında bir kızla tanışıyor. Başka bir dünyadan gelen, kendine güvenen ve yeşil deste kullanan Yoku Albatrosa ile birlikte Shunta, başlangıçta Kötü Tanrı Kral'ı mühürleyen on iki Tanrı Kral'ı bulmak için yola koyuluyor.