Aklı simgeleyen Mavi Dünya, içgüdüyü simgeleyen Kırmızı Dünya kökenli Nightfly O'Note adlı yaratıkların sürekli saldırısı altındadır. Blue World'de araştırmacı olan 17 yaşındaki kahramanı Akira Asagi, Ishigaki ve Iriomote adalarındaki gururlu bir savunma tesisi olan Ryuukyuu LAG'da savaşa liderlik etmek üzere aday gösterildi. Beşinci birimi yok eden şiddetli bir savaştan dört yıl sonra kurulan altıncı savaş birimi "IS" ile tanışır. Akari, Scared Rider Xech'ler olarak da adlandırılan bu altı biniciyi diğer dünyaya karşı savaşmaya ve aynı zamanda aralarındaki ilişkiyi derinleştirmeye yönlendirmelidir.