Bir lise son sınıf öğrencisi Murakami Ryouta'nın bir kazada ölen Kuroneko adında bir çocukluk arkadaşı vardı. Ryouta, Kuroneko ile evrende uzaylılar olduğunu kanıtlayacağına dair söz vermişti. Sözünü yerine getirmek için okuldaki astronomi kulübüne tek üye olarak katıldı ve neredeyse her gece yıldızları gözlemlemeye devam etti. Bir gün Kuroneko'ya benzeyen bir kız sınıfına alındı. Kızın adı, çocukluk arkadaşının ismine gerçekten benzeyen Kuroha Neko'dur. Ancak görünüşe göre onda alışılmadık bir şey var. Aslında bir araştırma laboratuvarından kaçan bir cadı olduğu ortaya çıktı.