Anime'nin ortamı Sugomori Şehri adlı kurgusal bir Japon şehridir. Bir gün, Noriko Sonosaki sınıf arkadaşı Katsuhira Agata'ya "Kiznaiver olmak için seçildiniz" diyor. Katsuhira'nın yaralarını paylaşmasına izin veren Kizuna Sistemi, onu hayatları ve kişilikleri tamamen ondan farklı olan sınıf arkadaşlarına bağlar. Kizuna Sistemi, insanları yaralar aracılığıyla birbirine bağlayan dünya barışının uygulanması için eksik bir sistemdir. Bu sisteme bağlı olan herkese Kiznaivers denir. Bir Kiznaiver yaralandığında, sistem yarayı diğer Kiznaiver'ler arasında böler ve iletir. Sugomori Şehri ıslah edilmiş arazi üzerine kuruludur, ancak yıllar geçtikçe şehrin nüfusu azalmaktadır. Hikaye, Katsuhira ve diğerlerinin yaşadığı bu kasabada geçiyor.