Sungkyunkwan Scandal, Kral Jeongjo'nun saltanatı sırasında Joseon döneminin sonlarında Sungkyunkwan Üniversitesi'nde, dört gencin maceraları ve aşk hikayeleri etrafında dönüyor. Küçük erkek kardeşinin hastalığı kötüleştiğinde ve ailesi parasızlıktan evlerinden tahliye edilme tehlikesiyle karşı karşıya kaldığında, Kim Yoon Hee onu desteklemek için çaresizce bir erkek kılığında okula onun adı altında girer. Orada zeki ve dürüst Lee Sun Joon, playboy Goo Yong Ha ve asi Moon Jae Shin ile arkadaş olur.