Hikaye, nişanlısı yaptığı bir ameliyattan sonra vejetatif bir durumda yatarken, son iki yılını acı içinde geçiren Minakata Jin adlı bir beyin cerrahını takip ediyor. Bir gün hastanede bayılır ve uyandığında kendini zamanda geriye, Edo dönemine taşınmış olarak bulur. Yakında bir samuray tarafından saldırıya uğrar, ancak Kyotaro adında bir adamın yardımıyla kaçar. Kyotaro onu korumaya çalışırken başından ciddi bir şekilde yaralandı, ancak Jin uygun tıbbi ekipman olmamasına rağmen hayatını kurtarmayı başardı. Bu nedenle Kyotaro'nun kız kardeşi Saki, Jin ile ilgilenmeye başlar ve onun asistanı olur. Bu arada Jin, günümüze dönmenin bir yolunu bulmaya kararlıdır.