Kaname Chidori, modern Japonya'daki ortalama çocuğunuz. En azından, Souske Sagara adında bir çocuk onu takip etmeye başlamadan önce, tamamen paranoyak bir askeri ucube gibi davranmaya başlamadan önce düşündüğü şey buydu! Okul gezisi kaçırılıp Kuzey Kore'ye götürüldüğünde, Kaname'nin kaçırılıp Fısıldandığı söylendiğinde işler açıklanmaya başlar. Fısıldayanlar, matematik, bilim ve teknolojinin muazzam miktarlarda inanılmaz derecede gelişmiş bilgisiyle doğan varlıklar olan genetik anormalliklerdir. Souske onu kurtarmaya gelir ve gizli askeri organizasyon MITHRIL'de eğitimli bir uzman olduğunu, dünyayı korumaya ve Fısıldayanları teröristler tarafından kötüye kullanılmaktan koruyacağına yemin eder. Şimdi onun ne olduğu ve Souske'nin ne yapması için gönderildiği bilgisi ile liseyi tek parça halinde tamamlayabilir mi?