Ergenlik çağındaki kız ve erkek çocukların küçük bir yüzdesi arasında özel yetenekler ortaya çıkar. Yū Otosaka gücünü başkaları bilmeden kullanır ve oldukça normal, ortalama bir okul hayatı yaşar. Ondan önce aniden bir kız ortaya çıkar, Nao Tomori. Onunla görüşmesi nedeniyle, özel güç kullanıcılarının kaderi ortaya çıkacak.